Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Psma1Q9R1P4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Psma1Q9R1P4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms