Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Psma4Q9R1P0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Psma4Q9R1P0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms