Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rfwd2Q9R1A8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rfwd2Q9R1A8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms