Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NrkQ9R0G8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NrkQ9R0G8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NrkQ9R0G8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms