Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zeb2Q9R0G7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zeb2Q9R0G7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms