Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Plod1Q9R0E2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Plod1Q9R0E2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms