Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nubp2Q9R061 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms