Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col4a3Q9QZS0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Col4a3Q9QZS0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms