Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
VapbQ9QY76 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
VapbQ9QY76 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms