Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxe3Q9QY14 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxe3Q9QY14 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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