Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nufip1Q9QXX8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms