Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Kcnip3Q9QXT8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms