Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnpy2Q9QXT0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnpy2Q9QXT0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms