Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg2Q9QXK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg2Q9QXK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms