Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apbb1Q9QXJ1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apbb1Q9QXJ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms