Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Limd1Q9QXD8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Limd1Q9QXD8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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