Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lsm4Q9QXA5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lsm4Q9QXA5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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