Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cyth1Q9QX11 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cyth1Q9QX11 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms