Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rai2Q9QVY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rai2Q9QVY8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms