Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mid2Q9QUS6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mid2Q9QUS6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms