Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkl2Q9QUK0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkl2Q9QUK0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms