Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Csnk1eQ9JMK2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Csnk1eQ9JMK2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms