Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2bQ9JME9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vstm2bQ9JME9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms