Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Prg4Q9JM99 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg4Q9JM99 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg4Q9JM99 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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