Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SrfQ9JM73 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms