Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rabgef1Q9JM13 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms