Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd2apQ9JLQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd2apQ9JLQ0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms