Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tlr5Q9JLF7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tlr5Q9JLF7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms