Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TefQ9JLC6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TefQ9JLC6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TefQ9JLC6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms