Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp4Q9JKV5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms