Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Irx5Q9JKQ4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Irx5Q9JKQ4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms