Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pole3Q9JKP7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pole3Q9JKP7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms