Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Stx6Q9JKK1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms