Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nectin1Q9JKF6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms