Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scamp5Q9JKD3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scamp5Q9JKD3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms