Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ap3m1Q9JKC8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms