Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Msgn1Q9JK54 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msgn1Q9JK54 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms