Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gfra4Q9JJT2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gfra4Q9JJT2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms