Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Herpud1Q9JJK5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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