Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Riox1Q9JJF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Riox1Q9JJF3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms