Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smad9Q9JIW5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smad9Q9JIW5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms