Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Praf2Q9JIG8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms