Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RabggtaQ9JHK4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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RabggtaQ9JHK4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RabggtaQ9JHK4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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RabggtaQ9JHK4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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RabggtaQ9JHK4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RabggtaQ9JHK4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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