Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tmod3Q9JHJ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms