Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cldn12Q9ET43 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn12Q9ET43 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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