Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ush1cQ9ES64 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ush1cQ9ES64 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms