Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp29Q9ES63 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp29Q9ES63 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Usp29Q9ES63 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp29Q9ES63 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Usp29Q9ES63 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp29Q9ES63 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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