Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trappc4Q9ES56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trappc4Q9ES56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms