Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rapgef4Q9EQZ6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms