Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tlr9Q9EQU3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr9Q9EQU3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tlr9Q9EQU3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms